醫學實驗動物研究所成立于1980年，是中國醫學科學院的專業研究所之一。研究所是從事實驗動物學和比較醫學科研與教學的專業研究所，是國內集實驗動物和疾病動物模型資源創制、保種和生產供應、比較醫學技術研究、及實驗動物技術培訓于一體的研究單位，是國家級的傳染病和新藥創制研究的實驗動物技術平臺的承擔單位，是衛生部人類疾病比較醫學重點實驗室和國家中醫藥局三級實驗室。研究所通過了國家實驗室認可及國際AAALAC認證。
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